376 articles
Cette étude révèle que la co-option d'un rétrotransposon spécifique à la souris régule l'usage d'isoformes d'ASH2L via un mécanisme d'interférence transcriptionnelle, permettant ainsi de préparer les promoteurs de gènes développementaux pour l'embryogenèse et la différenciation des motoneurones.
Cette étude démontre que les mutations de DDX3X associées au médulloblastome confèrent aux cellules une résistance à l'inhibition de TORC1 en favorisant la traduction sélective de transcrits à croissance rapide possédant des UTR 5' non structurés, contournant ainsi les contrôles de croissance induits par le stress.
Cet article présente le problème MASS et des algorithmes associés pour résumer les ensembles de structures d'ARN en identifiant simultanément des motifs structuraux partagés et en regroupant les structures en clusters, comblant ainsi les lacunes des méthodes existantes qui ne traitent que l'un de ces deux aspects.
En combinant des approches structurales et fonctionnelles, cette étude élucide les mécanismes dynamiques par lesquels le régulateur à double rôle Cti6, ainsi que les facteurs de transcription Ash1 et Ume6, recrutent le complexe Sin3, révélant ainsi les principes d'assemblage qui facilitent la transition entre la répression et l'activation génique.
Cette étude identifie, grâce à une approche de criblage à haut débit et à l'apprentissage profond, 29 variants génétiques modulant l'activité des enhancers dans les cellules épithéliales pulmonaires et susceptibles de modifier le risque de formes graves de COVID-19.
L'article présente InvDNA, une méthode d'apprentissage profond de bout en bout qui conçoit des séquences d'ADN simple brin directement à partir de coordonnées atomiques du squelette, surpassant les approches existantes en taux de récupération de séquence et démontrant sa capacité à replier des séquences conçues dans des conformations prédéfinies.
Cette étude révèle que l'expression de Myc dans les cellules basales de l'épithélium respiratoire supérieur est essentielle à la réparation tissulaire post-influenza en orchestrant un circuit épithélio-immun qui recrute des cellules effectrices CD8+ NKT via l'axe CXCL10-CXCR3, positionnant ainsi ces cellules comme des sentinelles spécialisées de l'immunité des voies aériennes.
En appliquant un cadre de modélisation stochastique aux données de séquençage ARN monocellulaire du projet Tabula Muris Senis, cette étude quantifie la dynamique des délétions de l'ADN mitochondrial dans les muscles de souris, révélant qu'elles résultent de mutations rares suivies d'une expansion clonale rapide menant à une dominance complète en environ trois mois.
Cette étude caractérise moléculairement les épidémies de virus chikungunya en Kenya entre 2017 et 2020, révélant la prédominance du lignage de l'océan Indien avec des mutations d'adaptation vectorielle, une transmission locale distincte à Mombasa et Dadaab-Hagadera, ainsi que des signes cliniques spécifiques (douleurs musculaires, maux de tête, convulsions) permettant d'améliorer le diagnostic différentiel dans les régions dépourvues de tests rapides.
Cette étude révèle que le déplacement d'une variante génétique de la chaîne α3 vers la chaîne α5 du collagène IV, bien qu'induisant une pathologie glomérulaire minime, provoque un épaississement marqué de la capsule de Bowman en altérant la bioactivité du scaffold α565-α121, soulignant ainsi le rôle critique de ce dernier dans l'organisation de la membrane basale.
Cette étude démontre que l'annexine A2 régule la fonction du surfactant pulmonaire lors d'une ventilation lésionnelle en maintenant les niveaux de POPG et la capacité de réduction de la tension superficielle, suggérant ainsi son potentiel comme cible thérapeutique pour prévenir la dysfonction du surfactant dans le SDRA.
L'étude démontre que la délétion des ARN roX chez les mâles de Drosophile empêche la compensation de dosage, mais que la viabilité est préservée par l'acquisition rapide de chromosomes X supplémentaires, un processus réversible par l'expression de roX2 complet.
Cette étude démontre que les états immunométaboliques circadiens régulent la réponse des macrophages aux protéines Spike du SARS-CoV-2 via des changements métaboliques et mitochondriaux centraux, créant deux phases temporelles distinctes de suppression ou d'activation immunométabolique conservées chez la souris et l'humain.
Cette étude révèle que l'exposition aux PFAS (PFOA et GenX) induit une toxicité et des perturbations des voies de signalisation p53 et TGF-β de manière spécifique au type cellulaire et au composé, le GenX s'avérant globalement moins cytotoxique que le PFOA.
Cet article présente deux nouvelles plateformes, scGOAT-seq et GlycoScope, qui intègrent l'accessibilité fonctionnelle des glycans aux analyses multiomiques à l'échelle de la cellule unique et spatiale, révélant ainsi des programmes de remodelage glycanique spécifiques aux stimuli et à l'environnement tumoral non détectables par les méthodes traditionnelles.
Cette étude démontre que la protéine GTPase Drg1, conservée au cours de l'évolution, assure l'intégrité mitochondriale en régulant la traduction des protéines essentielles à la surface de la membrane mitochondriale externe, établissant ainsi un point de décision crucial pour la coordination entre la synthèse protéique cytoplasmique et la fonction mitochondriale.
Cette étude révèle que des mutations oncogéniques dans le domaine chromodomaine de la protéine suppresseur de tumeur TIP60 perturbent son assemblage trimérique et son activité acétyltransférase par un mécanisme allostérique, empêchant ainsi l'activation des gènes de réparation de l'ADN et favorisant l'instabilité génomique.
En analysant des données protéomiques de tissus auriculaires de chèvres, cette étude révèle que la fibrillation auriculaire entraîne une adaptation mitochondriale systémique coordonnée, où la protéine HSPA9 agit comme un régulateur central de la dysfonction de la chaîne respiratoire et de la production d'énergie.
Cette étude révèle que la protéine Sfx, homologue d'H-NS codée par le plasmide R6K, assure le silence spécifique de son opéron de transfert conjugal en formant des filaments nucléoprotéiques stables via la séparation de phases et en recrutant le facteur Rho pour arrêter l'élongation transcriptionnelle, créant ainsi une niche régulatrice distincte de celle d'H-NS.
Cette étude démontre la faisabilité de l'utilisation d'oligonucléotides vivo-morpholino pour le knockdown génique chez le stickleback à trois épines, en validant la délivrance dans les organes cibles et en observant un knockdown réussi de *Spi1b* dans la rate, tout en soulignant la nécessité d'optimiser les méthodes de délivrance pour améliorer la reproductibilité et l'efficacité.